Το ωράριο λειτουργίας όλων των πρατηρίων είναι ελεύθερο, ενώ προβλέπεται υποχρεωτική εκ περιτροπής λειτουργία τόσο κατά τις νυχτερινές ώρες όσο και τις Κυριακές και αργίες. Ειδικότερα, κατά τη νυχτερινή λειτουργία τα πρατήρια που συμμετέχουν στο σύστημα εκ περιτροπής θα καλύπτουν το 10% του συνόλου και θα λειτουργούν από τις 10.30 μ.μ. έως τις 6 π.μ., με ελάχιστη διάρκεια λειτουργίας δύο ωρών. Αντίστοιχα, για τις Κυριακές και αργίες προβλέπεται εκ περιτροπής ημερήσια λειτουργία για το 25% των πρατηρίων, με ωράριο από τις 6 π.μ. έως τις 10.30 μ.μ.
Στο σύστημα συμμετέχουν υποχρεωτικά και τα πρατήρια που διαθέτουν αυτόματους πωλητές, ενώ οι ιδιοκτήτες υποχρεούνται να αναρτούν σε εμφανές σημείο το πρόγραμμα λειτουργίας. Η μη τήρηση των υποχρεώσεων επισύρει κυρώσεις, όπως προβλέπεται από τη σχετική νομοθεσία.
